Search In this Thesis
   Search In this Thesis  
العنوان
COMPARATIVE GENOMIC STUDIES ON SOME MARINE FISH \
المؤلف
MOHAMED, RANA ASHRAF GAMAL-ELDIN.
هيئة الاعداد
باحث / رنا أشرف جمال الدين محمد
مشرف / محمد عبد السلام راشد
مشرف / محمود مجدي عبد الله
مناقش / عبد الهادي ابراهيم حسن سيد
تاريخ النشر
2021.
عدد الصفحات
70 p. :
اللغة
الإنجليزية
الدرجة
ماجستير
التخصص
علوم الأحياء المائية
تاريخ الإجازة
1/1/2021
مكان الإجازة
جامعة عين شمس - كلية الزراعة - الوراثة
الفهرس
Only 14 pages are availabe for public view

Abstract

الخصائص المورفولوجية تمثل الخط الأول والواضح لتحديد الأسماك. ومع ذلك ، لا يستطيع المستهلكون تحديد أنواع الأسماك. لذلك فإن التحديد الموثوق به لأنواع الأسماك أمر ضروري لكشف ومكافحة الأخطاء في الأسواق. يعد التشفير الرمزي للحامض النووي أحد الأساليب الأكثر استخدامًا وفعالية . وهو يعتمد على التنوع المتسلسل لمنطقة قصيرة من الحمض النووي (DNA barcode) في الجينوم الذي يمتلك نسبة عالية من النوع.
الهدف من الدراسة هو تطبيق تقنية الـ barcoding DNA لبعض الأسواق المصرية من الأسماك البحرية من البحر الأحمر للتعرف عليها ، مقارنة الأنواع التي تم أخذ عينات منها باستخدام متواليات COI للتطور ولتقدير المسافة الجينية بين النوعية. خطة العمل:
1) تم عزل DNA من الذيل والزعانف لبعض أسماك البحر الأحمر التجارية.
2) ثلاث عينات سمكية ذات أهمية تجارية باهظة الثمن من البحر الأحمر كانت ناجحة في DNA barcoded باستخدام تقنيه تسلسل COI.
3) تحليل منتجات PCR بواسطة الفصل الكهربائي.
4) تنقية وقراءة تتابعات منتج الـ PCR.
5) استخدم أداة البحث محاذاه التتابع (BLAST) لتحديد التسلسل في قواعد البيانات. استخدام محاذاة التتابع متعددة وأدوات بناء الشجرة لتحليل العلاقات التطورية.
النتائج الرئيسية لهذه الدراسة كانت على النحو التالي:
(1ثلاث عينات سمكية ذات أهمية تجارية باهظة الثمن بغبغان (1) و ناجل (2) و كحايا (3)تم بنجاح ترميز الحمض النووي باستخدام تسلسل COI.
2) تم عمل blasted الثلاث عينات باستخدام قاعدة البيانات NCBI ، وتراوحت النتائج التي تم تحديدها من قبل الأنواع من 100 ٪ إلى 99 ٪ مما يدل على أن الأنواع لا. بغبغان (1) و ناجل (2) و كحايا(3) تطابق تام مع Scarus collana, Epinephelus tauvina and Sargocentron spiniferum.
3) كانت النتيجة أنه تم التعرف على الببغان (1) بشكل صحيح ، في حين تم توزيع الناجل (2) و الكحايا (3) عن طريق الخطأ تحت اسم آخر وفقا لتسميتهم بسوق السمك.
4) سمكة ناجل والتي يبلغ سعرها بالسوق 160 جنيهاً / كيلوغراماً greasy grouper في حين أنها تشبه في الشكل المورفولوجي إلى الهامور المرقط الذي يمكن أن يتم تسميته أو حتى استخدامه كسمك مزيف وبيعه باسم ناجل
5) سمكه الكحايا والتي يبلغ سعرها بالسوق 60 جنيهاً / كيلوغراماً تم العثور عليها على أنها السنجاب الشائك في حين أنها تشبه في الشكل المورفولوجي إلى سمك بلوتشي الجندي.
في الختام ، قمنا بتطبيق تقنية الترميز الشريطي للحمض النووي (DNA) على بعض الأسواق المصرية من الأسماك البحرية من البحر الأحمر والتي تم تصنيفها وفقاً لسوق السمك ناجل وكحايا وبغبغان ومقارنة عينات العينة باستخدام تسلسل COI للتطور ولتقدير المسافة الجينية بين النوعية. . وأظهرت النتائج أنه تم التعرف على بغبغان بشكل صحيح ، في حين أن ناجل وكحايا تم تسميتهم عن طريق الخطأ تحت اسم آخر وفقا لسوق السمك. تم تسجيل المتواليات الجديدة في قاعدة بيانات الباركود وقاعدة البيانات الخاصة بنك الجينات لضمان التحديد الصحيح المستقبلي لتلك الأنواع.