Search In this Thesis
   Search In this Thesis  
العنوان
Circulating Free Nucleic Acid Expression in Spinal Cord Injury /
المؤلف
Salah,Sara Mohammed Mohammed.
هيئة الاعداد
باحث / Sara Mohammed Mohammed Salah
مشرف / Hanaa El- Tayeb Nasser
مشرف / Mohamed Farid El-Asmer
مشرف / Ayman El-Sayed Shafei
تاريخ النشر
2019
عدد الصفحات
189p.:
اللغة
الإنجليزية
الدرجة
الدكتوراه
التخصص
Biochemistry, Genetics and Molecular Biology (miscellaneous)
تاريخ الإجازة
1/1/2019
مكان الإجازة
جامعة عين شمس - كلية الطب - الكيمياء الحيوية الطبية والبيولوجيا الجزيئية
الفهرس
Only 14 pages are availabe for public view

from 189

from 189

Abstract

تعتبر اصابات النخاع الشوكي من أهم الحوادث التى يتم استقبالها بالمراكز الرئيسيه لعلاج الاصابات الكبرى بمصر وذلك بمعدل مريض من كل 40 مريض. وتمثل أمراض النخاع الشوكي 63 لكل 1000000 من مجموع السكان. حيث أن امراض الحبل الشوكي نتيجه الاصابة في الحوادث تمثل 18 لكل 100000 ، في حين أن أمراض النخاع الشوكي الناتجة عن أسباب أخرى كانت بمعدل 45 لكل 100000 في عام 2013 وفقًا لـ El Tallawy et al.
تنص فرضية الأحماض النووية الريبوزية الداخلية المتنافسة (ceRNA) على أن جميع أنواع الحمض النووي الريبوزي المستنسخه تتنافس على الأحماض النووية الصغيرة من خلال آلية تتوسط فيها عناصر استجابة الحمض النووي الريبوزي الصغير (MREs). بناءً على هذه الفرضية ، يمكن لنسخ الأحماض النووية الريبوزية غير ناسخة والناسخة التي تمت مشاركتها مع عناصر استجابة الحمض النووي الريبوزي القصير التواصل مع بعضهم البعض لتنظيم مستويات التعبير الخاصة بهم.
وفقا لهذه النتائج، استخدمنا النهج التكاملي القائم على الطريقة الحسابية مع التحقق من الفاعلية الطبية لتقديم رؤى ممتازة في الآليات الجزيئية لحالات الاصابة بالحبل الشوكي. على حد علمنا ، إنها المرة الأولى التي يتم فيها تقييم شبكة من الحمض النووى الريبوزي الحامل للرساله (TP53INP2) والحمض النووي الريبوزي الطويل الغير ناسخ (LncRNA TSIX) والحمض النووى الصغير المستهدف (miRNA1283) والاطلاع عليهم من قواعد البيانات العامة.
تم اجراء هذ البحث بقسم الكيميا ء الحيوية الطبية والبيولوجية الجزيئية بكلية الطب - جامعـة عـين شمس ، وذلك في الفترة من (يناير 2017- يوليو 2018).
الهدف من البحث:
1. الهدف الأول هو تقييم تعبير الجين المرتبط بالاصابه في الحبل الشوكي:الحمض النووى الريبوزي الرسول (TP53INP2) و الحمض النووي الريبوزي الطويل الغير ناسخ (LncRNA -TSIX) و الحمض النووي الرايبوزي صغير الحجم(miRNA-1283) في مرضي الاصابه في الحبل الشوكي.
2. الهدف الثاني هو التحقق من صحة النتائج في مجموعة من مرضى اصابات النخاع الشوكي مقابل مجموعات المتطوعين الأصحاء باستخدام طرق البيولوجيا الجزيئية الحديثة والكشف عن مدى حساسية وفاعلية هذه الطرق.
3. من المتوقع أن نحدد على الأرجح الشبكة الوراثية الجديدة المرتبطة بالاصابه بالحبل الشوكى ، مما يشكل الأساس لتسخير هذه الشبكة الوراثية كأهداف علاجية . علاوة على ذلك ، فإننا نعتمد استراتيجيات بديلة لإدارة أفضل لحالات الاصابه باحبل الشوكى استنادًا إلى المقاربة الحسابية المدمجة والتحقق السريري
المرضى وطرق البحث:
شملت الدراسة 100 حاله مصنفة إلى ثلاث مجموعات رئيسية:
 المجموعة الأولى: 23 حالة حادة من إصابات النخاع الشوكي مع متوسط العمر 43 سنة.
 المجموعة الثانية: 41 حالة مزمنة لإصابة النخاع الشوكي بعمر متوسط 48 سنة.
 المجموعة الثالثة: 36 من الأفراد المتطوعين الأصحاء الذين يبلغ متوسط عمرهم 44 سنة.
معايير الاشتمال للمجموعة المصابة بالحبل الشوكى:
1. أن يكون المرضى >١٨ عاما وقت توقيع الموافقة المسبقة
2. امكانية وجود موافقة كتابية مسبقة
3. اثبات لتشخيص الاصابه بالحبل الشوكي وفقا للجمعية الأمريكية لدراسة أمراض الاصابه بالحبل الشوكى.
معايير الاستبعاد للمجموعة المصابه بالحبل الشوكى:
 الاضطرابات النفسية أو غيرها من الاضطرابات العصبية.
 المرضى الذين يعانون من أي مرض التهابي ، المناعة الذاتية أو الأورام غير النخاع الشوكي.
وجميع المشاركين تم اخذ التاريخ الطبي المفصل، واعطوا نموذج موافقة مستنيرة للانضمام إلى الدراسة
تم توثيق المعلومات التالية من سجلات المرضى:
1. التاريخ الشخصي والفحص السريري الدقيق كاملا.
2. فحص اشعاعي كامل.
وتم اخذ عينة من مصل الدم لكل مشترك في الدراسة. تمت الموافقة على إجراءات جمع العينات من قبل اللجنة الأخلاقية للبحوث كلية الطب، جامعة عين شمس
• تحليل بيولوجيا المعلومات الحيوية:
تم تحليل قواعد البيانات المعتمدة علي الدراسات السابقة لتحديد المؤشرات الحيوية الواعدة ذات الصلة باصابات الحبل الشوكى, و قواعد البيانات الخاصة بدلالات الأورام من اجل توقع بعض الأحماض الريبوزية النووية ذات الصلة باصابات الحبل الشوكى.
• تحليل عينات الدم :
تم فصل الحامض النووي الريبوزي الرسول المرتبط بالاصابه في الحبل الشوكي الحمض النووى الريبوزي الرسول (TP53INP2) و الحمض النووي الريبوزي الطويل الغير ناسخ (LncRNA -TSIX) و الحمض النووي الرايبوزي صغير الحجم(miRNA-1283 (من المصل ثم استنساخه بواسطة تفاعل البلمرة المتسلسل في الوقت الحقيقي - Real time PCR باستخدام بادئات محددة لجينات TP53INP2)) و الحامض النووي الريبوزي الطويل الغير ناسخ LncRNA-TSIX) ( و الحمض النووي الريبوزي صغير الحجم((miRNA-1283
• وقد تم اجراء تقييما إحصائيا لنتائج هذه الدراسة من خلال مقارنة مرضى الاصابه الحاده في الحبل الشوكى بالمرضى المصابون باصابه مزمنه في الحبل الشوكى وأصحاء متطوعين والكشف عن فروق معنوية ذات دلالة احصائية.(p value <0.05)
ووجدنا علاقة عكسية كبيرة للغاية بين الحمض النووى الريبوزى القصير- 1283 والحمض النووى الحامل للرسالة TP53INP2 على أساس التغييرات في الطي (RQ) بين مجموعة الدراسة الثلاثة (r = -560 ، P = 0.000).
من ناحية أخرى ، كان هناك ارتباط إيجابي كبير للغاية بين الحمض النووى الريبوزى الطويل الغير ناسخ TRIX والحمض النووى الريبوزى الحامل للرساله TP53INP2 على أساس التغييرات في الطي (RQ) بين مجموعات الدراسة الثلاث (r = 0.577 ، p = 0.000).
فيما يتعلق بالعلاقة بين الحمض النووى الريبوزى القصير 1283 والحمض النووى الريبوزى الطويل الغير ناسخ TRIX ، كان هناك ارتباط عكسي كبير للغاية يعتمد على تغيير الطي (RQ) بين مجموعات الدراسة الثلاث (r = - 481 ، p = 0.000).
ومع ذلك ، في المجموعات المريضة كان هناك فقط علاقة ايجابيه كبيرة للغايه بين الحمض النووى الريبوزى الطويل الغير ناسخ TRIX والحمض النووى الريبوزى الحامل للرساله TP53INP2 مما يعكس التغير في تفاعل العلامات البيولوجية في المجموعات المريضة.
لوحظ وجود اختلاف كبير في معدل الإيجابية للتعبير الجيني للحمض النووى الريبوزى الحامل للرسالهTP53INP2 ، الحمض النووى الريبوزى القصير 1283 والحمض النووى الريبوزى الطويل الغير ناسخ TSIX في عينات مصل مجموعة الاصابه الحادة في الحبل الشوكى (91.3 ٪ ، 82.6 ٪ و 91.3 ٪) بالمقارنة مع مجموعة الاصابة المزمنة في الحبل الشوكي (92.7 ٪ ، 87.8 ٪ ٪ و 95.1٪) والمجموعة الطبيعية السليمة (19.4٪ ، 5.6٪ و 16.7٪) على التوالي (P = 0.000).
باستخدام تحليل منحنى روك ، تم اختيارهم(≤0.598 and, ≥ 1.48, ≥2.005) كقيم مقطوعة للتعبير الجيني للحمض النووى الريبوزى الحامل للرساله TP53INP2 ،و والحمض النووى الريبوزى الطويل الغير ناسخ TSIX و الحمض النووى الريبوزى القصير 1283 على التوالي لتمييز المرضي من الحالات الغير مريضة. أظهروا حساسية (93.75 ٪ ، 92.1 ٪ و 85.9 ٪ على التوالي) ، والنوعيه (83.33 ٪ ، 80.55 ٪ و 94.4 ٪ على التوالي) ، والقيمة التنبؤية الإيجابية PPV من (90.9 ٪ ، 89.4 ٪ و 96.5 ٪ على التوالي) ، والقيمة التنبؤية السلبية NPV من (88.2 ٪ ، 85.3 ٪ و 79.1 ٪ على التوالي) ودقة التعبير (90 ٪ ، 88 ٪ و 89 ٪ على التوالي).
في الختام ، نتائج دراستنا دعم فرضيتنا السابقة أن التعبير الجيني TP53INP2 ، lncRNA TSIX و miRNA-1283 يمكن التعبير عنها في حالات الاصابة بالحبل الشوكى وبالتالي يمكن استخدامهما كأهداف علاجية محتملة لحالات الصابة بالحبل الشوكى.