Search In this Thesis
   Search In this Thesis  
العنوان
Developing Enhanced Models for Analysis of Gene Expression Data \
المؤلف
Ali, Mahmoud Mounir Mahmoud.
هيئة الاعداد
باحث / محمود منير محمود علي
مشرف / محمد عصام خليفة
مشرف / محمد حمدي العليمي
مناقش / محمد عصام خليفة
تاريخ النشر
2018.
عدد الصفحات
164 p. :
اللغة
الإنجليزية
الدرجة
الدكتوراه
التخصص
Information Systems
تاريخ الإجازة
1/1/2018
مكان الإجازة
جامعة عين شمس - كلية الحاسبات والمعلومات - الحاسبات و المعلومات
الفهرس
Only 14 pages are availabe for public view

from 164

from 164

Abstract

لقد أتاحت التقنية الدقيقة لصف الحامض النووي إمكانية مراقبة مستويات تعبير آلاف الجينات بشكل آني أثناء العمليات الحيوية المهمة وعبر مجموعات العينات المترابطة. إن عملية تَوضيح الأنماطِ المختفية في بيانات تعبير الجينِات تساهم بشكل كبير في إتاحة الفرصة لفهم أفضل لعلم الجينات الوظيفي. فمع تزايد أعداد الجينات و تعقيد الشبكات الحيوية تزداد التحديات لفهم و ترجمة البيانات الناتجة عن ذلك و التي عادة ما تحتوي على الملايين من القياسات. من أهم المراحل لتحقيق هذا الهدف هو تطبيق تقنيات إكتشاف التجمعات في بيانات تعبيرات الجينات المرتبطة مع بعضها البعض.
و كان البحث موجهاً في هذه الرسالة لتحقيق هذا الهدف و هو إكتشاف التجمعات في تعبيرات الجينات و كانت النتائج الرئيسية لهذه الرسالة كما يلي:
1- تقديم بعض التعريفات و المصطلحات البيولوجية الهامة لأي قارئ للرسالة حت يتسنى له متابعة العمل الموجود بها مع تقديم وصف مختصر لبيانات التعبيرات الجينية لمرض سرطان الثدي.
2- تقديم مصطلح حديث لاكتشاف التجمعات في بيانات التعبيرات الجينية و هو اكتشاف التجمعات ثنائي الاتجاه للجينات المصفوفة مع بعضها البعض.
3- تقييم أداء الخوارزميات المختلفة المطبقة في إكتشاف التجمعات في تعبيرات الجينات.
4- إقتراح منهجية جديدة لتصنيف تقنيات إكتشاف التجمعات الثنائية الاتجاه بناءً على نوعية المجموعات المراد البحث عنها.
5- تقييم أداء تقنيات إكتشاف التجمعات الثنائية الاتجاه مثل δ-biclustering, SAMBA, XMOTIFs و العديد من التقنيات الأخرى.
6- إقتراح و تنفيذ منهجية جديدة تسمى ” Correlation-Based Dilated Biclusters (CBDB)”.المبني على ايجاد مجموعة الجينات باستخدام معاملات الترابط بين الجينات.
7- تطبيق المنهجية المقترحة على بيانات جينية تعبيرات حقيقية و مصنعة للتحقق من جودة المنهجية.
8- مقارنة النتائج الخاصة بهذه المنهجية مع النتائج الخاصة بالمنهجيات الأخرى و ذلك للتحقق من جودة و صلاحية هذه المنهجية.
9- تطبيق المنهجية المقترحة على بيانات تعبيرات جينية حقيقية خاصة بمرض سرطان الثدي و هذه البيانا تحنوي ايضا على بيانات علاجية مثل حجم المرض و درجته و أيضا نسب الشفاء.
10- تقييم أداء تطبيق المنهجية المقترحة على البيانات الجينية و العلاجية لسرطان الثدي لتوضيح العلاقات المختلفة بين الجينا ت و التطور المرضي و العلاجي و ذلك للمساعدة في عمليات إيجاد علاج مناسب لهذ المرض.