Search In this Thesis
   Search In this Thesis  
العنوان
Molecular identification of species-specific adenovirus causing respiratory tract infection in pediatric patients at benha university hospital /
المؤلف
Azab, Marwa Said El-Sayed.
هيئة الاعداد
باحث / مروة سعيد السيد عزب
مشرف / أمــــال منيــــر متـــــى
مناقش / سمية مدنى دسوقى
مناقش / ريم رفعت عبد الجليل
الموضوع
Pediatric respiratory diseases. Infectious diseases. Medical microbiology.
تاريخ النشر
2020.
عدد الصفحات
216 p. ;
اللغة
الإنجليزية
الدرجة
الدكتوراه
التخصص
الطب
تاريخ الإجازة
1/1/2020
مكان الإجازة
جامعة بنها - كلية طب بشري - الميكروبيولوجيا الطبية والمناعة
الفهرس
Only 14 pages are availabe for public view

from 216

from 216

Abstract

تعد التهابات الجهاز التنفسي الحادة تهديدا كبيرا على الأطفال في جميع أنحاء العالم. حيث ان أكثر من 90٪ من هذه الحالات ناتجة عن عدوى فيروسية. ويعتبر الفي روس الغديAdV) )ِ أحد أهم الفيروسات المسببة لالتهابات الجهاز التنفسي لدى الأطفال والتي تصل إلى 15٪ من الحالات التى تم تشخيصها.
تعتبر عدوى الفيروس الغديAdV))ِ الأكثر شيوعًا في الأطفال اقل من 5 سنوات ، وهي غالبا من الامراض التى تتعافى سريعا دون تدخل . ومع ذلك ، فإن نسبة صغيرة من الأطفال يصابون بالتهابات تنفسية حادة بسبب الفيروس الغدى ، والتي يمكن أن تسبب مضاعفات مزمنة ، مثل التهاب الشعب الهوائية الانسداديية وتمدد الشعب الهوائية وفشل تنفسي حاد والوفاة عند الأطفال.
تنجم عدوى الجهاز التنفسي الحادة بسبب الفيروس الغدي( AdV) غالبا عن ثلاثة أنواع: AdV-B , AdV-C , AdV-E. وقد تتغير الأنواع الأكثر شيوعًا من الفيروس الغدى التي تسبب التهابات الجهاز التنفسي الحادة لدى الأطفال على مر السنين وفي المناطق المختلفة.
عدوى الفيروس الغدى AdV تتشابه اكلينيكيا مع فيروسات الجهاز التنفسي الأخرى ، كما أن التشخيص السريع و النهائي لنوع الفيروس يمثل مشكلة ولا يمكن تحقيقه بسهولة اكلينيكيا. و نظرًا لطول مدة بقاء وانتشار الفيروسات الغدية ، يجب أن تكون طرق التشخيص حساسة بما فيه الكفاية للكشف عن النسب المنخفضة من الفيروس في عينات المرضى .
ان الطرق التقليدية لتشخيص العدوى المختلفة بسببAdV تتم باستخدام الكشف عن الانتيجنات الخاصة باستخدام اختبار الفحص المناعي الفلوروسنتى وايضا باستخدام طرق زراعة الانسجة .
يعد الكشف عن الانتيجينات لغالبية فيروسات الجهاز التنفسي مفيدًا ، ولكن هذه الطرق لديها حساسية أقل مقارنة بزراعة الانسجة لتشخيص الفيروس الغدى كما تفتقر زراعة الانسجة إلى الحساسية للكشف عن النسب المنخفضة من الفيروس ، وقد تتطلب أسابيع لتحقيق نتائج محددة.
لّذلك فان الاختبارات التشخيصية الجزيئية مثل تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) تقدم مزايا اكثرمن الطرق الاخرى من حيث السرعة والحساسية والقدرة على التحديد الكمى للفيروس.
ان الهدف من هذه الدراسة هو تحديد الأنواع الأكثر انتشارًا من الفيروسات الغدية (AdV) المسببة لامراض الجهاز التنفسى في الأطفال الذين تم إدخالهم إلى مستشفى بنها الجامعى والمقارنة بين طريقة زراعة الأنسجة واختبار تحديد الانتيجنات الفلوروسنسى المباشر (DIF) بالنسبة الى تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR) فى تشخيص الفيروس الغدى المسبب لامراض الجهاز التنفسى .
أجريت هذه الدراسة المقطعية في قسم الميكروبيولوجيا الطبية والمناعة ، كلية الطب ، جامعة بنها من يناير (2019) إلى أبريل (2020).
لقد أجريت الدراسة الحالية على إجمالي 60 مريضاً من الأطفال المصابين بالتهابات الجهاز التنفسي الحادة. وكان الاطفال المرضى 39 ذكرا و 21 أنثى وتتراوح أعمارهم من شهر واحد إلى 10 سنوات. تم إدخال 35 مريضاً إلى اقسام المرضى الداخلية و16 مريضاً إلى وحدات العناية المركزة للأطفال بينما كان 9 مرضى في غرفة الطوارئ بمستشفى بنها الجامعي.
تم تجميع 5 نضحات أنفية بلعومية ، و 45 مسحة من الحلق و 10 نضحات من القصبة الهوائية من بين 60 مريضًا خضعوا لهذه الدراسة.
خضعت جميع العينات لما يلي:
1- الكشف عن الفيروس الغدي عن طريق تحديد الانتيجنات بالاختبار الفلوروسنتى المناعى المباشر (DIF).
2- استخدام زراعة الأنسجة كطريقة قياسية وروتينية لعزل الفيروس الغدي يليه تأكيد وجوده فى هذة الانسجة باستخدام اختبار DIF.
3- التشخيص الجزيئي للأنواع الفيروسات الغدية من خلال تفاعلات سلسلة البلمرة المتعددة (PCR).
كشفت الدراسة الحالية عن:
كان هناك 14 حالة إيجابية بنسبة (23.3٪) باستخدام اختبارDIF وذلك من أصل 60 حالة خضعوا لهذه الدراسة ، و يعتبر ظهور اللون الاخضرالتفاحى في الخلية بأكملها نتيجة إيجابية كما تعتبرالنتيجة سلبية إذا لم يتم رؤية اللون الفلوروسنسى فى الخلايا.
كان هناك 19 حالة إيجابية (31.7٪) باستخدام طريقة زراعة الأنسجة لعزل ِ الفيروس الغدى وذلك من أصل 60 حالة ،و كان ظهور أي اعتلال فى الخلايا من تضخم وتكتل او استدارة لمدة تصل إلى أسبوعين يعتبر إيجابيًا. وتعتبر النتيجة السلبية إذا بقيت الخلايا دون تغيير بعد فترة الحضانة لأكثر من أسبوعين. تم تأكيد وجود الفيروس الغدي في الأنسجة المزروعة باستخدام اختبار DIF. ووجد أن جميع الحالات الإيجابية باستخدام زراعة الأنسجة كانت إيجابية باختبار DIF.
كما تم تحديد 21 حالة ايجابية للفيروس الغدى باستخدام تفاعل البلمرة المتسلسل من بينهم كان AdV-B أكثر الأنواع انتشارًا حيث تم تحديد 16حالة (76.2٪) يليه AdV-C حيث تم تحديد 4 حالات (19.0٪) و حالة واحدة من AdV-E ) %4.8 ).
كانت نسبة الحساسية لطريقة زراعة الأنسجة 90.5٪ ونسبة الخصوصية 100٪ عند مقارنتها بـ PCR كطريقة مرجعية لتشخيص التهابات الجهاز التنفسي عند الأطفال بسبب الفيروس الغدى. 0.925. كما تمت مقارنة اختبارDIF الى طريقة PCR ، وكانت نسبة الحساسية 61.9٪ ونسبة الخصوصية 97.4٪.
وباعتبار طريقة زراعة الأنسجة كطريقة قياسية روتينية ،فقد تمت مقارنة نتائج اختبار DIF مع نتائج زراعة الأنسجة و كانت نسبة الحساسية لاختبار DIF 68.4 )٪( ونسبة الخصوصية 97.6٪ .كما تمت مقارنة نتائج PCR مع نتائج طريقة زراعة الأنسجة و كانت نسبة الحساسية 100٪ ونسبة الخصوصية 95.1٪.
وتم تشخيص معظم العينات الإيجابية للفيروس الغدى من الذكور13حالة (61.9٪) بينما الاناث 8 حالات (38.1%) ، وكانت الغالبية العظمى من المرضى 17 حالة (81٪) أقل من 5 سنوات مع وجود فرق يعتد به إحصائياً (P <0.05).بينما المرضى الاكبرمن 5 سنوات 4حالات) 19.0 ٪) فقط.
اما بالنسبة الى أعراض الجهاز التنفسى بين الأطفال المصابين بالفيروس الغدي ، كانت الحمى 85.7 ٪ ، سيلان الأنف 57.1 ٪ ، السعال 76.2 ٪ وضيق التنفس 47.6 ٪ الاكثر شيوعًا. وشملت اعراض اخرى خارج الجهاز التنفسى مثل الإسهال (19.0٪)
كان الالتهاب الرئوي هو التشخيص الاكلينيكى السائد بين الحالات الإيجابية للفيروس الغدى بنسبة (42.8٪) ويليه عدوى الجهاز التنفسى العلوى( ٪33.3) مع وجود فرق يعتد به إحصائياً (P <0.05).بينما الالتهاب الشعبى 19.0٪ والربو 4.8٪.
كانت هناك امراض اخرى مصاحبة للاصابة بالفيروس الغدى عند الأطفال بنسبة 57.1 ٪ وتعد الاضطرابات الرئوية وأمراض القلب الخلقية وعدم اكتمال النمو والامراض الوراثية مع الإقامة الطويلة في المستشفى الأكثر شيوعًا.
وبحسب توزيع العينات المأخوذة من الحالات الإيجابية لـ AdV ، فإن 66.6٪ كانت من مسحات الحلق و 28.5٪ من تشفيط الشعب الهوائية و 4.8٪ من غسل البلعوم الانفى . وتم تحديد معظم أنواع AdV التي تم تشخيصها باستخدام PCR من مسحات الحلق حيث أن AdV- B كان بنسبة 68.75 ٪ و AdV-Cبنسبة 75.0٪
اتاحت الدراسة الحالية تكوين صورة عامة عن أنواع الفيروسات الغدية الشائعة لدى الأطفال في مستشفى جامعة بنها. واتضح أن الأنواع السائدة هي AdV-B و AdV-C و AdV-E على التوالي. كما استنتجت هذة الدراسة ان طريقة التشخيص الجزيئي للفيروسات الغدية من خلال تفاعلات سلسلة البلمرة المتعددة (PCR) مفيدة للتشخيص السريع لعدوى الفيروس الغدي بحساسية أعلى من الكشف عن الانتيجنات وزراعة الأنسجة.
لذا من الضرورى ان تكون هناك دراسة مستمرة على الفيروس الغدى على مستوى الانواع والفصائل باستخدام التسلسل البروتينى وذالك للتعرف على انواع جديدة والتى من الممكن ان تسبب انتشار للعدوى خلال الفصول المختلفة على مدار العام.