Search In this Thesis
   Search In this Thesis  
العنوان
Detection of carbapenemases directly from positive blood cultures by blood culture carbapenem inactivation method (bcCIM) compared to modified carbapenem inactivation method (mCIM) in bloodstream infections/
المؤلف
Metwally,Safaa Emam Mohamed
هيئة الاعداد
باحث / صفاء امام محمد متولي
مشرف / نهال أنور فهيم
مشرف / نيرمين محمود أحمد
تاريخ النشر
2021
عدد الصفحات
147 p:
اللغة
الإنجليزية
الدرجة
ماجستير
التخصص
علم الأحياء الدقيقة (الطبية)
تاريخ الإجازة
1/1/2021
مكان الإجازة
جامعة عين شمس - كلية الطب - الميكروبيولوجيا الطبية والمناعة
الفهرس
Only 14 pages are availabe for public view

from 149

from 149

Abstract

Background: Early detection of bloodstream infections (BSIs) caused by carbapenemase-producing organisms can guide rapid lifesaving appropriate therapy. A new variant of the modified Carbapenem Inactivation Method (mCIM) test, named blood culture CIM (bcCIM), can directly detect carbapenemase enzymes from positive blood culture.
Objective: This study aimed at comparing detection of carbapenemase
activity in Gram-negative bacilli (GNB) by Carbapenem Inactivation Method on
positive blood culture and isolated colonies.
Methodology: bcCIM test was used to detect carbapenemase production in 38 positive blood cultures. Subculture of blood samples followed by isolation and identification of causative pathogens was done, antimicrobial susceptibility by disk diffusion test as well as performing mCIM test were applied to all isolated GNB. Results: Forty-one GNB were isolated. Klebsiella spp. was the most common isolated GNB 16 (39%). Most isolated GNB were carbapenemresistant 31(75.6%). For monomicrobial bloodstream infection, there was fair (kappa =0.327), moderate (kappa=0.429), and slight agreement (kappa=0.158) between results of mCIM and results of bcCIM as regards all GNB, Enterobacteriaceae, and Pseudomonas, respectively.
Conclusion: bcCIM is a promising test for direct detection of carbapenemase activity, particularly in carbapenem-resistant Enterobacteriaceae. Further studies are needed for the standardization of this method.
يمكن للاكتشاف المبكر لعدوى مجرى الدم التي تسببها الكائنات الحية الدقيقة خاصة العصيات السالبة الجرام المفرزة لإنزيم الكارباينيم من ايجاد العلاج المناسب الذي قد ينقذ العديد من الارواح. كما يمكن للمتغير الجديد للاختبار التثبيطي للكارباينيم المعدل والمسمي بالاختبار التثبطي للكارباينيم لمزارع الدم من اكتشاف انزيم الكارباينيم مباشرة من مزارع الدم الايجابية.
هدفت هذه الدراسة إلى مقارنة الكشف عن نشاط انزيم الكاربابينيم في العصيات سالبة الجرام بواسطة اجراء الاختبار التثبيطي للكاربابينيم على كلا من مزارع الدم الايجابية و مستعمرات البكتيريا المعزولة للعصيات السالبة الجرام.
تم استخدام الاختبار التثبطي لكاربابينيم لمزارع الدم لكشف عن إنتاج انزيم الكاربابينيم علي 38 مزرعة دم إيجابية. تم زرع عينات الدم الايجابية علي المستنبتتات البكتيريه بغرض عزل البكتيريا المسببة و التعرف عليها و تم اختبار حساسيتها للمضادات الحيوية عن طريق استخدام اختبار الانتشار القرصي وكذلك إجراء اختبار التثبطي الكاربابينيم المعدل على جميع العصيات السالبة الجرام المعزولة.
فقد تم عزل 41 عينة من العصيات سالبة الجرام وكانت بكتيريا الكلبسيلا المعزولة الأكثر شيوعًا 16 (39٪). وقد وجد ان معظم المعزولات من العصيات سالبة الجرام كانت أكثر مقاومة للكاربابينيم 31 (75.6٪). بالنسبة لعدوى مجرى الدم أحادي الميكروب، كان هناك علاقة اقل من متوسطة (كابا = 0.327)، علاقة متوسطة (كابا = 0.429)، واتفاق طفيف (كابا = 0.158) بين نتائج الاختبار التثبطي للكاربابينيم المعدل ونتائج الاختبار التثبطي للكاربابينيم لمزارع الدم فيما يتعلق بجميع المعزولات من العصيات سالبة الجرام و الأمعائيات و البكتيريا الزائفة على التوالي.
كانت حساسية ونوعية الاختبار التثبطي للكاربابينيم لمزارع الدم في الكشف عن العصيات سالبة الجرام والمنتجة لإنزيم الكاربابينيم 58.6٪ و 100٪ على التوالي. و كانت الحساسية والنوعية في الامعائيات المنتجة لإنزيم الكاربابينيم 60٪ و 100٪ على التوالي بينما في حالة البكتيريا الزائفة المنتجة لإنزيم الكاربابينيم ، كانت 42.9٪ و 100٪. في حالة الراكدة البومانية، كان الاختبار التثبطي للكاربابينيم لمزارع الدم قادرًا على اكتشاف 5 من أصل 7 (71.4٪) من البكتيريا الراكدة المنتجة لانزيم الكاربابينيم و التي تم تاكيد انتاجها لانزيم الكاربابينيم بواسطه الاختبار التثبطي المعدل للكاربابينيم.
يعد الاختبار التثبطي للكاربابينيم لمزارع الدم واعدًا للكشف المباشر عن نشاط إنزيم الكاربابينيم، لا سيما في البكتيريا المعوية المقاومة للكاربابينيم ولكن هناك حاجة إلى مزيد من الدراسات لتوحيد هذه الطريق