الفهرس 
IntroductionOnly 14 pages are availabe for public view
 |  | from | 166 |  |  |
| | | from | 166 | | |
Abstract
مرض جدري الاغنام هو مرض جلدي معدي خطير يعتبر من أهم الأمراض الفيروسية التي تصيب الأغنام. المرض مستوطن في مصر ، وهناك حاجة إلى مزيد من عزل وتوصيف فيروس جدري الاغنام لتوفير طرق أكثر فاعلية في إكتشاف ومكافحة تفشي الفيروس.
وبالتالي ، كان الهدف الرئيسي من هذا العمل هو دراسة العلاقة بين المعزولات الحقلية الجلدية لـمرض جدري الاغنام والعزلات الحقلية الجلدية من مرض الجلد العقدي من الأغنام والماشية المشتبه بها إكلينيكيا أثناء حدوث تفشي مرض الجلد العقدي في محافظة القليوبية ، مصر خلال 2018 ، و تجارب العزل الفيروسي والأساس الجزيئي لتحسين رؤى جديدة في علم الوبائيات والمساعدة في استحداث طرق جديدة لمكافحة فيروسات الجدري.
أظهرت الدراسات التطبيقيه النتائج الاتية:
1) بعمل مسح سيرولوجي لعينات المصل من الأغنام غير المحصنة بواسطة اختبار الاليزا للكشف عن الأجسام المضادة ضد فيروس جدري الاغنام في محافظة القليوبية ، مصر حيث بلغت النسبة الإجمالية للمصل الموجب 30٪ (30/100) من إجمالي أمصال الأغنام التي تم فحصها.
2) بعمل مسح سيرولوجي لعينات المصل من الأبقار غير المحصنة بواسطة اختبار الاليزا للكشف عن الأجسام المضادة ضد فيروس الجلد العقدي في محافظة القليوبية ، مصر حيث بلغت النسبة الإجمالية للمصل الموجب 60٪ (60/100) من إجمالي أمصال الماشية التي تم فحصها.
3) اظهر الانتشار المصلي للأجسام المضادة لـفيروس جدري الاغنام في أمصال الأغنام غير الملقحة بناءً على عمر الحيوان أن النسبة الأعلى تم اكتشافها في عمر 6 أشهر 36.6٪ (11/30) و 30٪ (9/30) خلال عمر سنة واحدة تليها 20٪ ( 6/30) في عمر 1.5-2.5 سنة ، ولكن تم الكشف عن نسبة أقل في الحيوانات الأكبر سنًا 3 سنوات 13.3 ٪ (4/30) من إجمالي العينات الإيجابية.
4) أظهر الانتشار المصلي للأجسام المضادة لـفيروس الجلد العقدي في أمصال الماشية غير المحصنة بناءً على عمر الحيوان أن النسبة الأعلى تم اكتشافها في عمر سنة واحدة 36.6٪ (22/60) و 25٪ (17/60) خلال 6 أشهر تليها 21.6٪ (13) / 60) في عمر 1.5-2.5 سنة بينما تم الحصول على نسبة منخفضة في عمر 3 سنوات بنسبة 16.6٪ (10/60) من مجموع العينات الإيجابية.
5) اسفرت تجارب العزل الفيروسي من عينات الآفات الجلدية المشتبه بها من الأغنام والماشية المصابة عن طريق ثلاثة تمريرات متصلة على الغشاء الكوريونى لأجنة البيض المخصب الخالى من الأمراض. وقد أدى الفيروس المعزول إلى ظهور الأثر الباثولوجى المميز والذى ظهر في شكل احتقان وتجلط للدم في الأوعية الدموية الخاص بالغشاء بالإضافة الى ظهور إصابات تنكرزية بيضاء صغيرة متفرقة ومتعددة وتعكر الغشاء لوحظ في 40٪ (10/25) ) للأغنام بينما ظهرت هذه الافات الملحوظة في 28 ٪ (7/25) للماشية من إجمالي عينات الآفات الجلدية المعزولة.
6) الكشف الجزيئي لمعزولة فيروس جدري الاغنام باستخدام اختبار البلمرة المتسلسل الذي يستهدف الجين ORF103 كان بنسبة 8٪ (2/25 (في عينات حليب من الأغنام السليمة الظاهرة و المشتبه في اصابتها و 50٪ (5/10) و 42.9٪ (3/7) من الاغشية الجنينية للتمريرة الثالثة المحصودة للعينات العقيدية من الأغنام والماشية بالإضافة إلى لقاح جدري الغنم كان ايجابيا واظهرت النتائج وجود منتج البلمرة المتسلسل محدد بالحجم الصحيح المتوقع (570 زوج قاعدي).
7) تم تحليل البيانات المتسلسلة المتوقعة ل 570 زوج قاعدي الخاصة بجين ORF103 من عينة الحليب الإيجابية وأظهرت تطابقها لفيروس جدري الاغنام. علاوة على ذلك ، أظهر تحليل برنامج BLAST أن المحاذاة المتعددة لتسلسل النوكليوتيدات للأمبليكونات التي تم الحصول عليها من الكشف الجزيئي عن تجانسها بنسبة97.1 ٪ مع تجانس النوكليوتيدات من السلالة الكازاخستانية لفيروس جدري NISKHI. بالإضافة تجانس 95-96٪ لتسلسل النيوكليوتيدات لعترة جدري الاغنام المكتشفة في محافظة المنوفية لسنة 2016 في مصر ،والسلالات الصينية (فيروس جدري الاغنام SPPV-GH)و(فيروس جدري الاغنام (SPPV-GL ، و سلالة كازاخستان لجدري الاغنام( Sheeppox virus A, complete genome (.
8) لمزيد من التأكيد ، تعرضت منتجات الحامض الديوكسي الريبوزي الجينومية المستخرجة لستة عينات معزولة إيجابية مختارة من الاغشيىة الجنينية للتمريرة الثالثة المحصودة إلى تفاعل البلمرة المتسلسل التقليدي لتضخيم الجين المسؤل عن بروتين الإندماجp32 وكشفت عن وجود منتج البلمرة المتسلسل محدد بالحجم الصحيح المتوقع (390 زوج قاعدي ).
9) المحاذاة المتعددة لتسلسل النوكليوتيدات لخمس امبليكونات لجين ORF103 كشفت أن عزلات الجلد العقدي كانت متطابقة إلى حد كبير بنسبة (94.29٪). وكانت عزلات جدري الغنم متطابقة بنسبة94.7)% ). عند المقارنة مع عترات أخرى من فيروسات الكابريبوكس ، تبين أن العزلات الحقلية لـفيروس الجلد العقدي من الماشية متطابقة لأكثر من 97-98) ٪) على مستوى النوكليوتيدات مع عزلات الجلد العقدي المصرية من المحافظات المجاورة في مصر(بني سويف والوادي الجديد لسنة 2018 والمنوفية لسنة 2017(.و على العكس أظهرت المتواليات بنسبة أقل من 95٪ تماثل لتسلسل النيوكليوتيدات لمعزولة جدري الاغنام المكتشفة في محافظة المنوفية في مصر لسنة 2016 وسلالة فيروس جدري الاغنام لمحافظة منيا القمح لسنة 2017.
10) تم اختيار عينتين إيجابيتين لجين المسؤل عن بروتين الاندماج P32 ومطابقتهما معًا مع سلالات أخرى من الجلد العقدي وجدري الاغنام و جدري الماعز المتوفرة في بنك الجينات. أظهرت المقارنة بين التسلسلين أنهما يشتركان في تشابه 92.33٪ مع بعضهما البعض. على نفس النمط لتحليل تسلسل الجينات ORF103 ، أظهر تحليل تسلسل الجينات P32 أن كلا من عزلات الجلد الحقلية لفيروس اـلجلد العقدي من الماشية وفيروس جدري الاغنام من الأغنام كانت أكثر ارتباطًا بـفيروس الجلد العقدي.
11) شجرة النشوء والتطور تم إنشاؤها لحساب وفحص علاقات التسلسل وإظهار العلاقة بين السلالات المعزولة للدراسة وسلالات فيروس الجلد العقدي وفيروس جدري الاغنام وفيروس جدري الماعز المتوفرة في قاعدة بيانات بنك الجينات. يُظهر تحليل النشوء والتطور أن سلالاتنا مرتبطة ارتباطًا وثيقًا بمجموعة فيروسات الجلد العقدي أكثر من فيروسات جدري الاغنام وفيروسات جدري الماعز.