Search In this Thesis
   Search In this Thesis  
العنوان
Role of restriction endonucleases in resistance to bacteriophage infection /
المؤلف
Atiya, Amany El-Sayed Ahmed.
هيئة الاعداد
باحث / أماني السيد أحمد عطيه
مشرف / يحيى عبدالمنعم عثمان اللازق
مشرف / عادل أحمد علي المرسي
مناقش / محمد إسماعيل ابودره
مناقش / محمد النجار
الموضوع
Endonucleases. Bacteriophages. Botany.
تاريخ النشر
2018.
عدد الصفحات
167 p. :
اللغة
الإنجليزية
الدرجة
ماجستير
التخصص
علوم النبات
تاريخ الإجازة
01/12/2018
مكان الإجازة
جامعة المنصورة - كلية العلوم - قسم النبات
الفهرس
Only 14 pages are availabe for public view

from 167

from 167

Abstract

تحلل العزلة المصرية من بكتيريا باسيلليس ثيرنجنيسيس ((BtaC18 المستخدمة كمصدر لمبيدات الآفات البيولوجية بالفيروسات اثناء عملية الصناعة يشكل مشاكل اقتصادية بالغة وبالتالي عزل وتعريف هذه الفيروسات ودراسة تلك الفيروسات على المستوى البيولوجى والجزيئى وكذلك ودراسة اتحاد الحامض النووي للفيروسات مع العائل واختيار انسب انزيمات القطع لتكسير المادة الوراثية للفيروس تمثل خطوة إلي الأمام في السيطرة علي الاضرار الاقتصادية لصناعة المبيدات الحيوية. فقد تم عزل وإكثار اللاقمات البكتيرية من السلالة BtaC18 وقد تم اختبار تلك الفاجات بختبارات الحساسية وترسيب الفاجات باستخدام PEG (8000). وتم فحص وتقييم الخصائص المورفولوجية للفاجات المعزولة باستخدام المجهر الالكتروني النافذTEM. وقد تم استخدام طريقة محسنة لإعداد كمية صغيرة من الحمض النووي للفاجات علي اساس الترسيب بواسطة كلوريد الزنك. تم إجراء تفاعل RAPD -PCR باستخدام 4 بوادئ قصيرة التتابع نتج عنه جزء من الحمض النووي، والذي تم تنقيته و استخلاصه من الهلام بواسطة Zymoclean Gel DNA Recovery Kit. تم تحديد التسلسل لمنتج RAPD-PCR المنقي من الفيروسات المختلفة باستخدام مرافق التسلسل التلقائي. تم تطبيق ادوات المعلوماتية الحيوية لتحليل تسلسل الحمض النووي لتتابع النيوكليوتيدات وذلك باستخدام عدد كبير من البرمجيات والمواقع لتحليل المتسلسلات. ولدراسة العلاقة بين الحامض النووي الفيروسي والحامض النووي الفيروسي تم استخدام بوادئ Primers خاصة بالفيروسات المعروفه سابقا بأنها تصيب بكتيريا الباسيلس ثيرنجينسيس وهذا لأنها تفيد في تحديد نوع الفاجات المعزلة واختبارها مع الحامض النووي للفيروسات. تم اختبار تلك البوادئ ايضا علي سلالات البكتيريا التي اثبتت مقاومتها للفاجات المعزولة. ويمكن تلخيص النتائج كالتالي: تم عزل 5 فاجات مختلفه في الشكل الظاهري لها. تم تعريف الفيروسات المعزولة علي مستوي البيولوجيا الجزيئية، حيث تم عمل RAPD-PCR باستخدام اربع بوادئ. وقد تم تحليل تسلسل الحمض النووي الذي تم الحصول عليه من الفيروسات قيد الدراسة الناتج بواسطة البوادئ الاربعة وذلك عن طريق دراسة التقارب باستخدام قاعدة البيانات NCBI واظهرت النتائج ان هناك تشابه بنسبة 75% مع الفاج PhBC6A51 وبنسبة 91% مع الفاج phiCM3وبنسبة 87% مع الفاج BMBP1.1 ونسبة 82% مع الفاج ProCM3. وقد تم تحليل الشكل الثنائي والثلاثي لبروتينات المتوقعة. وقد وضحت خريطة انزيمات القطع الخاصة بهذا التتابع. ولدراسة العلاقة بين جينوم البكتيريا وجينوم الفاج قد تم عمل PCR باستخدام 11 بادئ متخصص في الكشف عن الفاجات التي تصيب بكتيريا Bacillus thuringiensis. وهذا لان تلك البوادئ تساعد في تعريف انواع الفيروسات المعزولة وايضا عند تطبيق البوادئ التي اعطت نتيجة موجبة (مع جينوم الفاجات عددها 6 بوادئ) مع جينوم البكتريا اوضح الفاجات الموجودة في داخل الكروموسوم البكتيري للثلاثي سلالات. وقد اوضحت تلك النتائج دور الفاجات الملتحمة مع الكروموسوم البكتيري في سلالة BtaC18 في تحديد مقاومة او تحمل السلالة للإصابة بالفاج وبدراسة انزيمات القطع يمكن تحديد المناسب منها لاستخدامة ضد الفيروسات.